吉尔吉斯斯坦位于天山构造带，区域构造方向呈近东西向展布，其地质演化历史较长，最早可追到中古太古代，并且明显分为前中生代和中新生代2个阶段。前者地质构造复杂，组成了天山山脉主体，后者较简单，分布于山间盆地中。前中生代依近东南向的尼克利夫断裂和阿特巴希-伊尼尔凯克斯基断裂，自北向南分为北天山、中天山和南天山等3个主要构造带，同时又以NW向的特拉斯-弗家恩斯基断裂将上述各带分割为东、西2部分。